Тогда я не понял, чего Вы хотите -

Тогда я не понял, чего Вы хотите - чтобы в системе не было флоппа?..
Если так, то попробуйте после установки Винды флопп запретить в БИОСе везде (бывает, что он не по разу там встречается), и удалите флопп вместе с контроллером, а заодно дайте ссылку на Бивис, посмотрим, что там интересного...
BTW, установить 98-й без присутствия флоппа в системе, IMHO, у Вас вряд ли получится - установщик будет против...