Если посмотреть схему десктопной материнки, то TCK, TRST#,

Если посмотреть схему десктопной материнки, то TCK, TRST#, TMS, TDI на шине PCI притянуты
к VCC и GND.
Даже на "серверной" MS-6377 они не объединены в цепочку, а на набортном SCSI вообще на землю вглухую.

Так что вариант подлезть через PCI отпадает.

для +/- универсальности остаётся вариант проходного переходника для CPU, но опять-же
провести именно граничное сканирование не получится из-за того, что цепочка на плате не разведена....только если на AMD-шных платах на 780-м и выше чипсете она будет.

Поэтому остаётся только работать в режиме отладки через процессор, но для этого надо чтобы
по меньшей мере работал камень, тогда ещё худо-бедно можно протестить память (в случае с AMD напрямую ) , NB, возможно SB....при рабочих мостах можно добраться до периферии на LPC, PCI, PCI-E.....но без документации на всю цепочку сделать это ИМХО нереально