по поводу термопары, Вам нужна консультация того, кто

по поводу термопары, Вам нужна консультация того, кто пользует такой тип датчика, но в любом случае, термоконтакт должен быть надёжным и с малым сопротивлением (передачи теплу ессна), т.е. ну хотя-бы используйте термопасту (например КПТ-19, она выдерживает температурки получше восьмёрки и не затвердевает по окончании процесса)

по поводу крепления платы - первое, что напрашивается, сделать нормальный многоточечный крепёж (загляните в тему про самоделки)... и, возможно просто показалось, кажется расстояние до нижнего нагревателя какое-то огромненькое... зная алгоритм работы станции (а я тут только погадать смогу, ибо такой хреновиной не пользовался и не читал про неё особо ничего), можно хорошо себе представлять процесс насыщения платы теплом... мне так думается, что при высоком расположении платы, контроллер вынужден повышать температуру ВН, т.к. НН не эффективен на термопрофиле, вот и топите смолу