при включени вентилятор чуть дёргается и останавливается.
что это?
Похоже на КЗ по линии 12В. Проверьте замененный мосфератус на пробой, он, скорее всего, гавкнул. Как ведёт себя плата при отключении 4-х пинового разъема? И, кстати, какой ШИМ установлен?