Беда может быть и банально с конкретной матерью.

Беда может быть и банально с конкретной матерью. Похоже, что с работой на шине (PCI 32-bit) проблем нет особых, в Гугле есть success stories.
Да, вот еще - читали?
intel.com/support/ru/motherboards/server/srcs14l/sb/cs-006969.htm

Ну, и прошить ему последнюю прошивочку.