Желательно посмотреть осциллографом на выходе преобразователя, но сомневаюсь,

Желательно посмотреть осциллографом на выходе преобразователя, но сомневаюсь, что при неисправности одной из фаз, шим вообще запустится ИМХО, хотя можно представить работу шима и без одной/нескольких фаз.

Если температура растёт и спадает плавно, это не страшно, но при достаточно быстром нагреве и охлаждении может отвалиться ядро, а если при этом ещё и присутствует вибрация (биение) на кулере СО это только ускорит процесс ИМХО.